Vụ tranh chấp quyền tác giả kéo dài hơn 12 năm giữa ông Lê Linh và bà Phan Thị Mỹ Hạnh, ngày 03/09/2019, Tòa án Nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh mới tuyên án và công nhận ông Lê Linh là tác giả duy nhất của bộ truyện tranh Thần đồng Đất Việt. Theo nội dung đơn khởi kiện, họa sĩ Lê Linh đề nghị tòa án công nhận ông là tác giả duy nhất của hình tượng các nhân vật "Trạng Tí", "Sửu ẹo", "Dần béo" và "Cả Mẹo" trong bộ truyện tranh Thần đồng đất Việt gồm 78 tập; không thừa nhận bà Mỹ Hạnh là đồng tác giả trong việc sáng tác 4 nhân vật trên; đồng thời buộc Công ty Phan Thị phải chấm dứt việc tự tạo ra và sử dụng những biến thể khác nhau và các hình tượng do Lê Linh sáng tạo từ các tập Thần đồng đất Việt tiếp theo, cũng như trên các ấn bản khác như Thần đồng đất Việt khoa học, Thần đồng đất Việt Mỹ thuật… Công ty Phan Thị phải xin lỗi ông Lê Linh công khai trên các phương tiện thông tin đại chúng và thanh toán chi phí thuê luật sư bảo vệ tác quyền bị xâm phạm là 20 triệu đồng.[10]

Trong Công báo sở hữu công nghiệp vào ngày 25 tháng 11 năm 2020, nhãn hiệu 'Lê Linh' (tác giả 'Thần đồng đất Việt') được công ty Phan Thị nộp đơn đăng ký từ ngày 9 tháng 7 năm 2010 nhưng chưa được Cục Sở hữu Trí tuệ cấp giấy chứng nhận.[11]